MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 2

Total Repeats: 86869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008543	GC	3	6	8	13	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008543	GCGA	2	8	20	27	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008543	GCGA	2	8	33	40	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008543	CGG	2	6	46	51	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008543	GGCG	2	8	173	180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008543	GC	3	6	190	195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008543	CGGT	2	8	208	215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008543	GGC	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691274
9	NC_008543	GAC	2	6	265	270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691274
10	NC_008543	TCG	2	6	278	283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691274
11	NC_008543	CAG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691274
12	NC_008543	TGA	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691274
13	NC_008543	GC	3	6	447	452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008543	CGGG	2	8	454	461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008543	CGG	2	6	470	475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008543	GCG	2	6	476	481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008543	CG	3	6	484	489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008543	CGG	2	6	509	514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008543	GCG	2	6	550	555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008543	CG	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008543	GC	3	6	605	610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008543	GCC	2	6	624	629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008543	GGC	2	6	636	641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008543	GGC	2	6	649	654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008543	CG	3	6	676	681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008543	GCG	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008543	CGGG	2	8	747	754	0 %	0 %	75 %	25 %	162228942
28	NC_008543	GC	3	6	782	787	0 %	0 %	50 %	50 %	162228942
29	NC_008543	CGG	3	9	801	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
30	NC_008543	GCA	2	6	818	823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
31	NC_008543	CGA	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
32	NC_008543	TCT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
33	NC_008543	GCG	2	6	979	984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
34	NC_008543	TGC	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
35	NC_008543	GCGAC	2	10	1034	1043	20 %	0 %	40 %	40 %	162228942
36	NC_008543	CGC	2	6	1067	1072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
37	NC_008543	TGA	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
38	NC_008543	GGCC	2	8	1109	1116	0 %	0 %	50 %	50 %	162228942
39	NC_008543	CTTC	2	8	1133	1140	0 %	50 %	0 %	50 %	162228942
40	NC_008543	GTC	3	9	1179	1187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
41	NC_008543	TCG	2	6	1231	1236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
42	NC_008543	CAT	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162228942
43	NC_008543	TTC	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
44	NC_008543	GAT	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
45	NC_008543	CTT	2	6	1356	1361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
46	NC_008543	CGG	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
47	NC_008543	CCGA	2	8	1411	1418	25 %	0 %	25 %	50 %	162228942
48	NC_008543	TGC	2	6	1444	1449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
49	NC_008543	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
50	NC_008543	GCA	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
51	NC_008543	CCG	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
52	NC_008543	GCG	2	6	1598	1603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
53	NC_008543	TCG	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
54	NC_008543	CGACAG	2	12	1680	1691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
55	NC_008543	CGA	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
56	NC_008543	CAT	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162228942
57	NC_008543	CTT	2	6	1905	1910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
58	NC_008543	GTC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
59	NC_008543	GCG	2	6	1952	1957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
60	NC_008543	TGA	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
61	NC_008543	TTC	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
62	NC_008543	CTTG	2	8	1994	2001	0 %	50 %	25 %	25 %	162228942
63	NC_008543	ATG	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
64	NC_008543	CCG	2	6	2251	2256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
65	NC_008543	CAG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
66	NC_008543	TTC	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
67	NC_008543	CGG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
68	NC_008543	CGA	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
69	NC_008543	CAG	2	6	2360	2365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
70	NC_008543	GCC	2	6	2401	2406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008543	GC	3	6	2409	2414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008543	CGGCG	2	10	2475	2484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_008543	GGCA	2	8	2546	2553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008543	GCCCGG	2	12	2583	2594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008543	GCGGGG	2	12	2658	2669	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008543	GGC	2	6	2715	2720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008543	T	6	6	2743	2748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008543	CGG	2	6	2803	2808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008543	TGCG	2	8	2815	2822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008543	CAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008543	TCACT	2	10	2893	2902	20 %	40 %	0 %	40 %	116691276
82	NC_008543	CCG	2	6	2908	2913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691276
83	NC_008543	C	6	6	2954	2959	0 %	0 %	0 %	100 %	116691276
84	NC_008543	CTG	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691276
85	NC_008543	CAC	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691276
86	NC_008543	GCCG	2	8	3018	3025	0 %	0 %	50 %	50 %	116691276
87	NC_008543	CGC	2	6	3053	3058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691276
88	NC_008543	GCG	2	6	3065	3070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691276
89	NC_008543	AGC	3	9	3105	3113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691276
90	NC_008543	AATGCG	2	12	3145	3156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116691276
91	NC_008543	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691276
92	NC_008543	ACG	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691276
93	NC_008543	CGA	2	6	3230	3235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008543	GT	3	6	3245	3250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008543	CCGGCA	2	12	3282	3293	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008543	ACTTC	2	10	3306	3315	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008543	CGA	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008543	CGC	2	6	3450	3455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008543	TGC	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008543	CGCGC	2	10	3559	3568	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_008543	CG	3	6	3587	3592	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
102	NC_008543	CG	3	6	3600	3605	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
103	NC_008543	CGT	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
104	NC_008543	GC	3	6	3653	3658	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
105	NC_008543	GC	3	6	3690	3695	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
106	NC_008543	GTC	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
107	NC_008543	CATCAC	2	12	3777	3788	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116691277
108	NC_008543	GCA	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
109	NC_008543	CGGCCA	2	12	3821	3832	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116691277
110	NC_008543	GCAGC	2	10	3839	3848	20 %	0 %	40 %	40 %	116691277
111	NC_008543	GC	3	6	3851	3856	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
112	NC_008543	TCG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
113	NC_008543	GGC	2	6	3899	3904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691277
114	NC_008543	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
115	NC_008543	GCC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691277
116	NC_008543	GCA	3	9	4076	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
117	NC_008543	ATG	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691277
118	NC_008543	CGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
119	NC_008543	GC	3	6	4202	4207	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
120	NC_008543	CGA	2	6	4208	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
121	NC_008543	CGA	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
122	NC_008543	GTC	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
123	NC_008543	AGC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
124	NC_008543	CCA	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691277
125	NC_008543	CGA	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
126	NC_008543	GCG	2	6	4360	4365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691277
127	NC_008543	GCGCG	2	10	4471	4480	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
128	NC_008543	CG	3	6	4484	4489	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
129	NC_008543	CGGCG	2	10	4511	4520	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
130	NC_008543	CG	3	6	4526	4531	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
131	NC_008543	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008543	CGA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008543	GAC	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008543	TCG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
135	NC_008543	CGG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
136	NC_008543	CGTG	2	8	4835	4842	0 %	25 %	50 %	25 %	116691278
137	NC_008543	ACG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
138	NC_008543	GCCG	2	8	4887	4894	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
139	NC_008543	CGG	2	6	4904	4909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
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273	NC_008543	CAA	2	6	9400	9405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116691281
274	NC_008543	CGA	3	9	9435	9443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
275	NC_008543	GCG	3	9	9468	9476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691281
276	NC_008543	CGGCAA	2	12	9493	9504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
277	NC_008543	TCG	2	6	9537	9542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691281
278	NC_008543	CGG	2	6	9553	9558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691281
279	NC_008543	GCACCG	2	12	9588	9599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116691281
280	NC_008543	CGGCAC	2	12	9661	9672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116691281
281	NC_008543	ACG	3	9	9728	9736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
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283	NC_008543	CAG	2	6	9833	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
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287	NC_008543	GTCG	2	8	9979	9986	0 %	25 %	50 %	25 %	116691281
288	NC_008543	CGG	2	6	9987	9992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691281
289	NC_008543	GACT	2	8	10020	10027	25 %	25 %	25 %	25 %	116691281
290	NC_008543	CGG	2	6	10033	10038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691281
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294	NC_008543	ACG	2	6	10133	10138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
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299	NC_008543	GCT	2	6	10582	10587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691281
300	NC_008543	CGG	2	6	10591	10596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691281
301	NC_008543	GAC	2	6	10627	10632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
302	NC_008543	AACG	2	8	10642	10649	50 %	0 %	25 %	25 %	116691281
303	NC_008543	GGT	2	6	10652	10657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116691281
304	NC_008543	GGTT	2	8	10689	10696	0 %	50 %	50 %	0 %	116691281
305	NC_008543	GGCG	2	8	10738	10745	0 %	0 %	75 %	25 %	116691281
306	NC_008543	TAT	2	6	10772	10777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116691281
307	NC_008543	GGA	2	6	10810	10815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116691281
308	NC_008543	GCA	2	6	10827	10832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
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310	NC_008543	GCA	2	6	10861	10866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
311	NC_008543	ATCG	2	8	10900	10907	25 %	25 %	25 %	25 %	116691281
312	NC_008543	CG	3	6	10996	11001	0 %	0 %	50 %	50 %	116691281
313	NC_008543	TGC	2	6	11013	11018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691281
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315	NC_008543	GGC	2	6	11105	11110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691281
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337	NC_008543	CAT	2	6	11965	11970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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339	NC_008543	GACG	2	8	11998	12005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
340	NC_008543	GCG	2	6	12030	12035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
341	NC_008543	CG	3	6	12042	12047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
342	NC_008543	CGT	2	6	12095	12100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691282
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363	NC_008543	CGT	2	6	12992	12997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691283
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386	NC_008543	TGA	2	6	13791	13796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
387	NC_008543	GCC	2	6	13845	13850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
388	NC_008543	GGC	2	6	13856	13861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
389	NC_008543	CGG	2	6	13862	13867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_008543	TGG	2	6	13872	13877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
391	NC_008543	ACG	2	6	13915	13920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691284
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393	NC_008543	ACG	2	6	13960	13965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691284
394	NC_008543	CTT	2	6	14001	14006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116691284
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396	NC_008543	GTCG	2	8	14031	14038	0 %	25 %	50 %	25 %	116691284
397	NC_008543	TTGCCG	2	12	14077	14088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691284
398	NC_008543	CG	3	6	14105	14110	0 %	0 %	50 %	50 %	116691284
399	NC_008543	CG	3	6	14117	14122	0 %	0 %	50 %	50 %	116691284
400	NC_008543	CGG	2	6	14141	14146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691284
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404	NC_008543	CGG	2	6	14229	14234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691284
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